Eduskunnan apulaisoikeusasiamies on oikeustieteen tohtori, dosentti Jussi Pajuoja. Hänen toimikautensa alkoi 1.10.2009 ja se jatkuu 30.9.2013 asti.
Apulaisoikeusasiamies Pajuoja ratkaisee asiat, jotka koskevat muun muassa poliisia, sosiaalivakuutusta, työvoimahallintoa, syyttäjälaitosta ja puolustuslaitosta.
Ennen valintaansa apulaisoikeusasiamieheksi Jussi Pajuoja toimi oikeusasiamiehen kanslian kansliapäällikkönä. Hän on virkavapaalla oikeusministeriöstä, jossa hän on kriminaalipoliittisen osaston apulaispäällikkö.
Hän on työskennellyt oikeusasiamiehen kansliassa esittelijänä vuosina 1997-1999. Lisäksi hänellä on ollut opetus- ja tutkimustehtäviä Helsingin yliopiston oikeustieteellisessä tiedekunnassa ja Suomen Akatemiassa vuosina 1984 - 1995. Vuosina 1990 - 1991 hän oli vierailevana tutkijana Yhdysvalloissa.
Apulaisoikeusasiamies Pajuojan väitöskirja Väkivalta ja mielentila on vuodelta 1995. Tutkimus käsittelee väkivaltarikoksiin syyllistyneitä, heille tehtyjä mielentilatutkimuksia ja syyntakeisuussäännöksiä. Lisäksi Pajuoja on julkaissut lukuisia kirjoja ja tutkimusartikkeleita yksin ja muiden kanssa.